Rumah Sakit Daerah Muratara memiliki banyak fasilitas pelayanan unggulan yang telah dikembangkan sejak awal dan dalam memberikan pelayanan kepada klien. Sejak awal berdirinya, RS Muratara telah dikenal sebagai salah satu rumah sakit daerah dengan keunggulan dalam pelayanan gawat darurat. Hal tersebut didukung dengan ambulans yang lengkap, peralatan gawat darurat yang mumpuni dan tentunya dukungan tenaga medis serta unit perawatan intensif dan ruang operasi yang selalu siap 24 jam sehari.